En una nota publicada por la Sociedad Chilena de Ciencias Geográficas, Lilliam Quirós destacó su designación como Premio Milton Santos de Geografía, otorgado al profesor Flores en el XIII Encuentro de Geógrafos Latinoamericanos, realizado en Costa Rica en julio del 2011.
La entrega de este reconocimiento, dijo, “nos hizo recordar quién fue para los geógrafos y geógrafas de este país el paso de don Eusebio Flores (...) Fue un gran regalo para los geógrafos/as que lo conocimos y hemos seguido su trayectoria”.
El profesor Flores se desempeñó como geógrafo en la Escuela de Ciencias Geográficas de la Universidad Nacional de Costa Rica, en los años ’70, donde “realizó grandes aportes a la Geografía, ya que siendo director de la escuela impulsó y estableció las bases para que la enseñanza profesional de la Geografía tuviera una aplicación práctica, y para acercar a esta disciplina a la resolución de problemas sociales y ambientales”, señaló en la nota.
El libro Geografía de Costa Rica, agregó, “significó un despertar para las ciencias geográficas en Costa Rica. La obra de Eusebio no sólo llenó un vacío, sino que marcó un camino; reeditado en varias ocasiones el cual hoy día se utiliza como texto obligatorio en muchas asignaturas. Realizó investigaciones que para su época eran una necesidad. También, apoyó decididamente la creación de la Revista Geográfica de América Central, la cual es un orgulloso, de mantener actualizada. Después de vivir y hacer escuela en Costa Rica, regresó a su país donde culminó con éxito su gran carrera profesional”, concluyó.
El profesor Flores se desempeñó en el Departamento de Geografía del Instituto Pedagógico de la Universidad de Chile durante 15 años. También fue profesor en el Departamento de Historia y Geografía, de la Facultad de Historia, Geografía y Letras de la Universidad Metropolitana de Ciencias de la Educación por alrededor de 20 años.
En el 2007 recibió la distinción Orden al Mérito Docente y Cultural Gabriela Mistral en el grado de Caballero por su extensa trayectoria pedagógica en liceos y universidades nacionales y extranjeras, y por su significativo aporte a las Ciencias Sociales y en especial a la Geografía.